PLGrid i HPC
PLGrid i HPC — obliczenia dużej mocy dla badaczy
Interdyscyplinarne Pomorskie Centrum Medycyny Cyfrowej, we współpracy z ACK Cyfronet AGH, oferuje badaczom dostęp do infrastruktury obliczeniowej PLGrid.
Czym jest HPC? HPC (ang. High Performance Computing, obliczenia wielkiej skali) to wykorzystanie potężnych systemów obliczeniowych — superkomputerów łączących tysiące procesorów i kart graficznych (GPU) — do zadań, które przekraczają możliwości zwykłego komputera. Pozwala wykonywać w kilka godzin obliczenia, które na laptopie trwałyby tygodnie lub byłyby wręcz niewykonalne.
Czym jest PLGrid? PLGrid to ogólnopolska infrastruktura obliczeniowa dla nauki, udostępniająca środowisku badawczemu moc obliczeniową, przestrzeń dyskową oraz specjalistyczne oprogramowanie. Jej zasoby utrzymuje m.in. ACK Cyfronet AGH w Krakowie, operator jednego z najszybszych superkomputerów w Polsce. Dostęp do PLGrid jest bezpłatny dla naukowców i realizowany w ramach tzw. grantów obliczeniowych.
Do czego może służyć badaczom? Infrastruktura HPC sprawdza się wszędzie tam, gdzie pojawiają się duże zbiory danych lub złożone obliczenia — w medycynie cyfrowej są to m.in.:
- trenowanie modeli sztucznej inteligencji i uczenia maszynowego (np. analiza obrazów medycznych),
- analiza danych genomowych i sekwencjonowania (NGS),
- przetwarzanie dużych zbiorów danych klinicznych,
- symulacje i modelowanie procesów biologicznych,
- obliczenia statystyczne na dużą skalę.
Jak pomagamy? IPCMC wspiera badaczy na każdym etapie korzystania z infrastruktury PLGrid:
- pomoc w założeniu projektu obliczeniowego i uzyskaniu dostępu do grantu,
- przygotowanie danych do obliczeń w środowisku HPC,
- wsparcie w wykonaniu obliczeń — od konfiguracji zadań po ich uruchomienie i optymalizację.
Dzięki temu badacze mogą skupić się na swoich pytaniach naukowych, a formalne i techniczne aspekty pracy z superkomputerem biorą na siebie specjaliści Centrum.