Katalog działań realizowanych przez Centrum
1. Zarządzanie danymi badawczymi
- Projektowanie i utrzymanie hurtowni danych (Data Warehouse / Data Lake House) dla danych klinicznych, obrazowych i omicznych
- Nadawanie identyfikatorów trwałych (PID) i standaryzacja metadanych zgodnie z zasadami FAIR i HL7 FHIR
- Zarządzanie cyklem życia danych badawczych — od zbierania, przez przechowywanie, po archiwizację
- Bezpieczne przesyłanie dużych plików i zbiorów danych między instytucjami
2. Anonimizacja i ochrona danych
- Anonimizacja i pseudonimizacja danych medycznych zgodnie z RODO i wytycznymi EDPB
- Automatyczne usuwanie danych osobowych z tekstów wolnych (opisów klinicznych) z wykorzystaniem NLP/NER
- Generowanie danych syntetycznych do celów badawczych i testowych
- Wsparcie prawne i etyczne w zakresie zgód, dokumentacji oraz kontaktu z komisjami bioetycznymi
- Kodowanie próbek i zachowanie poufności danych powiązanych z materiałem biologicznym
3. Wsparcie analityczne i AI
- Analiza danych wielomodalnych (dane kliniczne, obrazowe, sekwencyjne) przy użyciu AI i uczenia maszynowego
- Budowa narzędzi wspierających decyzje kliniczne na bazie sztucznej inteligencji
- Automatyczna ekstrakcja zmiennych i klasyfikacja tekstów medycznych (NLP)
- Analizy typu genome-wide association, RNA sequencing, single-cell sequencing
- Wsparcie metodologiczne i statystyczne dla projektów badawczych oraz wniosków grantowych
4. Współpraca z biobankiem
- Pobieranie, izolacja i przechowywanie materiału biologicznego (krew, tkanki, płyny biologiczne)
- Ekstrakcja DNA/RNA oraz przygotowanie próbek do dalszych analiz, w tym sekwencjonowania genomowego (WGS)
- Monitorowanie warunków przechowywania i zapewnienie identyfikowalności próbek
- Tworzenie i zarządzanie nowymi kolekcjami próbek na potrzeby konkretnych projektów badawczych
- Krajowa i międzynarodowa wysyłka próbek oraz wymiana danych z innymi biobankami na podstawie umów MTA i DTA
5. Katalogowanie i udostępnianie zasobów
- Prowadzenie katalogu zbiorów danych, kohort i kolekcji biobankowych dostępnych dla badaczy
- Portal zgłoszeniowy umożliwiający zamawianie próbek, obrazów i danych przez jedno okno kontaktowe
- Integracja z międzynarodowymi katalogami i sieciami
6. Rozwój badaczy i promocja nauki
- Szkolenia i warsztaty z zakresu zarządzania danymi, narzędzi analitycznych i zasad etycznych
- Doradztwo w zakresie wniosków grantowych i oceny wykonalności projektów danych
- Wsparcie publikacyjne — repozytoria, bibliografia, promocja wyników badań
- Udostępnianie infrastruktury obliczeniowej (cloud, storage) dla zespołów badawczych